1967. aastal asus Sirje Kiin õppima Tartu Riikliku Ülikooli eesti filoloogia osakonda ajakirjanduse erialale. Järgnes aspirantuur, kuid kandidaadiväitekirja massikommunikatsiooniteooriast ei õnnestunud kaitsta. Uurimistulemused salastati ja sotsioloogilised uurimused kui sellised kuulutati nõukogude võimu poolt 1975. a keelatuks. Kiin lõpetas tegevuse sotsioloogina ning keskendus kirjanduskriitikale ja kirjandusteadusele. Ta on teinud biograafilist uurimistööd Eesti kirjanike Viivi Luige ja Kersti Merilaasi kohta. 2010. aastal kaitses ta Marie Underi elu ja loomingu teemal Turu ülikoolis doktoriväitekirja.
Kirjanduskriitika valdkonnaga tegelemine viis Kiini 1970. aastate teisel poolel tööle kultuurilehe Sirp ja Vasar toimetusse algul sotsioloogi, hiljem kirjandusosakonna juhatajana. Aastail 1978-82 töötas Kiin ajakirja Keel ja Kirjandus toimetuses peatoimetaja asetäitjana. Ametikoht oli nomenklatuurne, st eeldas kohustuslikku komparteisse kuulumist. Kiin astus 1979 NLKP liikmekandidaadiks.
Sirje Kiin osales 1980. aasta oktoobris eesti haritlaskonna avaliku pöördumise ehk nn 40 kirja tegemisel ja kümnete allkirjade kogumisel, kuid vastavalt kirja autorite kokkuleppele kirjutas perekonnast alla ainult üks inimene, abikaasa. Võimud küll seostasid Kiini 40 kirjaga, kuid ametlikult midagi tõestada ei suudetud. Sellele vaatamata jälitati teda ja tema perekonda mitu aastat, ta vallandati 1982. aastal töölt ideoloogilise sobimatuse tõttu ning visati NLKPst välja. 1980. aastail tegutses Kiin töötu teisitimõtlejana, koostades mitmeid käsikirju, mida aga tema poliitilise sobimatuse tõttu ei avaldatud.
1988 kutsus kirjanik Lennart Meri Sirje Kiini tööle äsja asutatud Eesti Kultuurifondi, kus tema ülesandeks oli suhete arendamine väliseestlastega. Aastail 1990-1998 töötas ta Raadio Vaba Euroopa Eesti toimetuse vabakutselise korrespondendina Soomes, Turus. 1999-2003 töötas Kiin Eesti Vabariigi Riigikogus Isamaa saadikurühma avalike suhete nõunikuna.
Alates 2003 on Kiin vabakutseline kirjandusteadlane. Ta elab USAs ning kirjutab regulaarselt kolumne väliseesti ajalehtedele.
