Eesti Ajaloomuuseumi eelkäija Eestimaa Provintsiaalmuuseum loodi 1864 ja hakkas tegutsema Kanuti gildi hoones Tallinnas. 1940. aastal muuseum riigistati ja selle baasil rajati Eesti NSV Riiklik Ajaloomuuseum. 1952 koliti muuseum Suurgildi hoonesse ja 1975 liideti Ajaloomuuseumiga Maarjamäe loss. 1989. aastal sai muuseumi nimeks Eesti Ajaloomuuseum. Tänapäeval moodustavad muuseumi Suurgildi hoone Tallinna Vanalinnas ning Maarjamäe loss ja selle kõrvalhooned. Ajaloomuuseum kogub erinevaid Eesti ajalooga seotud esemeid ja dokumente, sealhulgas Nõukogude perioodist. Sageli kogutakse uut materjali seoses ettevalmistatavate näitustega ning sel moel on Ajaloomuuseumisse jõudnud ka Juhan Aare kogu.